Dans Sword Art Online, le premier VRMMO en immersion totale, mourir dans le jeu signifie mourir dans la vie réelle. Emirun et Rex, qui se connaissaient avant d’entrer dans le jeu, se retrouvent par hasard et unissent leurs forces pour survivre. Après que leur équipe a été massacrée par le mystérieux PK connu sous le nom de « Black Swordsman », les deux héros décident de devenir plus forts. Déterminés à venger leurs camarades tombés au combat, ils partent à la recherche de la légendaire épéiste Asuna et entament un entraînement intensif. Dans un jeu mortel où même les autres joueurs peuvent devenir des ennemis, quel destin les attend à la fin de ce périple ?